MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR05

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014737	CG	5	10	50	59	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014737	G	6	6	88	93	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014737	GC	4	8	105	112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014737	CG	3	6	127	132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014737	TAC	2	6	143	148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014737	AG	4	8	172	179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014737	TC	3	6	185	190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014737	ACAGA	2	10	191	200	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014737	TTTTCT	2	12	216	227	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014737	TCT	3	9	225	233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014737	TC	3	6	258	263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014737	GGAC	2	8	269	276	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014737	CG	3	6	289	294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014737	GCT	2	6	317	322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014737	AGG	2	6	374	379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014737	CACG	2	8	414	421	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014737	AC	3	6	457	462	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014737	GC	3	6	479	484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014737	GGT	2	6	4586	4591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014737	GGAC	2	8	4599	4606	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014737	GGA	2	6	4714	4719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014737	GGT	2	6	5410	5415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014737	CGT	2	6	5513	5518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014737	ACG	2	6	5522	5527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014737	CAT	2	6	5552	5557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014737	CGA	2	6	5570	5575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014737	CCA	2	6	5576	5581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_014737	CGA	2	6	5582	5587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014737	C	6	6	10132	10137	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_014737	TCT	3	9	10140	10148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014737	TCC	2	6	10166	10171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_014737	CT	3	6	10213	10218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014737	C	6	6	10239	10244	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34	NC_014737	ACT	2	6	10296	10301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014737	G	6	6	10312	10317	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014737	GAG	2	6	10324	10329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014737	ACC	2	6	10399	10404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_014737	G	6	6	10429	10434	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014737	GCC	2	6	10471	10476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_014737	ACCG	2	8	12158	12165	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014737	ACA	2	6	12172	12177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014737	GTT	2	6	12200	12205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014737	TTCG	2	8	12244	12251	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014737	ACA	2	6	12906	12911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014737	GTT	2	6	12935	12940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014737	GTG	2	6	14704	14709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014737	GGA	2	6	14730	14735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014737	TAT	2	6	16058	16063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014737	TC	3	6	16953	16958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014737	CAC	2	6	16967	16972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_014737	CGA	2	6	17279	17284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014737	CGG	2	6	17364	17369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014737	CCA	2	6	17447	17452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_014737	GGT	2	6	17525	17530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.